聖隷奴学園、それは絶海の孤島に建設された一貫教育設備を有する巨大学園都市である。聖隷奴学園では3つの学科が基本となる。すなわち帝王科・普通科・奴隷科である。聖隷奴学園では入学時より1ヶ月ごとに、成績・人間性・社会性などさまざまな観点から生徒達を評価し、各クラスの生徒を3つの学科にそれぞれ振り分けを行う。帝王科は各クラス評価上位2名・奴隷科は各クラス評価下位2名と決まっており、普通科はそれ以外の生徒が所属する。　帝王科は普通科・奴隷科に対する支配権を持っており、奴隷科は帝王科・普通科に絶対服従しなければならない。　この物語は聖隷奴学園に入学した生徒達の非日常的現実を描いたSMストーリーである。