宇宙へと進出し始めた人類に脅威としてのしかかってきた未知の宇宙意志存在シャドー。それらへの本格的な攻撃艦隊として配備された旗艦ガーディエスト、シャドーは人間の心の不安、葛藤などを苗床に人間を支配する。果たして人類に勝算はあるかロボット型戦闘兵器パワードエレネーターを操る主人公マモルと彼の父、旗艦ガーディエストの艦長との葛藤の仲、広大な宇宙を舞台としたスペースロマン第一章…